对制药废水污染的治理要求从源头开始，因此对于制药工业要求进行清洁生产，减少废水的排放量和污染物量，此外，由于某些制药废水的生产工艺的特殊性，废水中含有大量的可回收利用的物质，所以应尽量对其进行回收利用，然后再对废水进行治理。

  污水处理设备生产厂对制药废水的治理，首先应加强物料回收和综合利用。通过改革工艺过程以减少污染物的排放量，如发酵菌体的回收利用，提取用溶剂的回收，工艺用重金属的回收等。对制药废水中的高浓度废水，可考虑制取饲料酵母，采取综合治理利用技术，既可创造经济效益，又可降低50%左右的COD，如生产金霉素等抗菌素的废水即可采用此方法。

  在各类工业废水中，医药工业的特点是品种多，生产规模差别大，单位产品排放污水量大，废水组成复杂废水中污染物浓度高，含有大量有毒、有害物质，大抗菌素是微生物、植物、动物在其生命过程中产生(或利用化学、物理或生物方法)的化合物，具有在低浓度下选择性地抑制或杀灭它种微生物或肿瘤细胞能力的化学物质，是人类控制感染性疾病，保障身体健康及防治动植物病害的重要药物。到目前为止，世界上各国发表的天然抗菌素已达3000多种，临床常用的约50多种。抗菌素的生产原料主要为粮食，在生产过程中，原料消耗大，只有少部分转化为产品和作为供给微生物生命活动的物质，大部分仍留在废水中。

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